Presso la Direzione nazionale antimafia e antiterrorismo il personale di polizia giudiziaria opera principalmente in tre gruppi: il Gruppo Interforze Ricerca e Analisi (G.I.R.A.), il Gruppo di lavoro Segnalazione Operazioni Sospette (Gruppo S.O.S.) e il Gruppo di lavoro Servizio Ordinamento Penitenziario (Gruppo S.O.P.).

Il Gruppo Interforze Ricerche e Analisi (GIRA) è istituito nell'ambito del servizio “Risorse tecnologiche, flussi e sicurezza”. È composto da ufficiali e agenti di polizia giudiziaria provenienti da diverse forze di polizia e opera mediante unità di lavoro corrispondenti alle Sezioni della DNA. 

Il Gruppo di lavoro per l’analisi delle Segnalazioni di Operazioni Sospette (SOS), istituito nell'ambito dell'omonimo Servizio, è composto da ufficiali e agenti di polizia giudiziaria del Nucleo Speciale Polizia Valutaria della Guardia di finanza (NSPV), del Servizio Centrale di Investigazione sulla Criminalità Organizzata (SCICO), della Direzione Investigativa Antimafia (DIA.) e del Raggruppamento operativo speciale dei Corpo dei Carabinieri (ROS).

Il Gruppo di lavoro Ordinamento penitenziario (SOP), istituito nell'ambito dell'omonimo Servizio, è composto da personale di polizia penitenziaria.